尔云间  一个专门做科研的团队

原创  小果  生信果  关注我们

(相关资料图)

对于Admixture软件生成的遗传结构分析结果进行可视化如果只使用boxplot函数，会比较单调如下图

如果想要绘图更赏心悦目一些可以使用R语言pophelper包，效果如下

如果上图成功引起了你的注意，那接下来就和小果一起敲代码吧

rm(list=ls());gc();BiocManager::install('pophelper')#安装依赖包install.packages(c("devtools","ggplot2","gridExtra","gtable","label.switching","tidyr"),dependencies=T)# install pophelper package from GitHubdevtools::install_github('royfrancis/pophelper')library(pophelper)library(data.table)options(stringsAsFactors = F)alist <- readQ(filetype="auto",list.files(path="D:/test/", full.names=T))alist<-alignK(alist)plotQ(alist,exportpath=getwd(),sortind="all" , height = 5,      width = 5,showyaxis = TRUE,imgtype="pdf",showlegend = TRUE,showdiv = FALSE,outputfilename="plotq7")plotQMultiline(alist,sortind="all",exportpath=getwd())

完工！！

以上就是小果的分享，是不是干货满满呢，小伙伴快去试试吧。

推荐阅读

使用R进行数据提取

看看差距有多大，R语言edgeR差异表达分析

这个调控因子到底调不调控我的基因啊！——小果带你来学习FIMO数据库

小果教你解读WGCNA分析中的cluster dendrogram图谱

关注小果，小果将会持续为你带来更多生信干货哦。

“生信果”，生信入门、R语言、生信图解读与绘制、软件操作、代码复现、生信硬核知识技能、服务器、生物信息学的教程，以及基于R的分析和可视化等原创内容，一起见证小白和大佬的成长。

关键词：